Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RWDD2BP57060 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms