Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRCA2P51587 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms