Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms