Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms