Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF9P41273 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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