Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC8A1P32418 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC8A1P32418 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms