Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DUSP1P28562 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms