Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms