Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRGP23470 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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