Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRDP23468 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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