Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
F13BP05160 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F13BP05160 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F13BP05160 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms