Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRCH4O75427 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms