Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTNBO60941 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms