Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMINO43313 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMINO43313 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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