Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LINC01387J3KSC0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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LINC01387J3KSC0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01387J3KSC0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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