Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms