Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms