Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms