Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms