Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00588Q9Y4M8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms