Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRF3Q9ULT6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms