Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms