Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB23Q9ULC3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms