Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms