Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms