Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLKQ9UBT6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms