Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PMCHL2Q9BQD1 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms