Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGAP1Q96PV0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms