Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms