Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLRP3Q96P20 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms