Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C9orf85Q96MD7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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