Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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