Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHDC9Q8NEP7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms