Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms