Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms