Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms