Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFWD3Q6PCD5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms