Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF549Q6P9A3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF549Q6P9A3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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