Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FAM208BQ5VWN6 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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