Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms