Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms