Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEN1Q17RS7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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