Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms