Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TLR1Q15399 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms