Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCM1Q15154 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms