Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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