Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms