Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGA7Q13683 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA7Q13683 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms