Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ACACAQ13085 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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