Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms